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尊龙凯时MGIEasy V30高效全基因组甲基化文库制备助力甲基化研究

发布时间:2025-01-29   信息来源:尊龙凯时官方编辑

近期,尊龙凯时针对DNBSEQ平台的甲基化建库与测序进行了全面升级,推出了新一代建库产品——MGIEasy全基因组甲基化文库制备试剂盒V30(MGIEasy Whole Genome Methylation Sequencing Library Prep Kit V30,以下称WGMSV30)。WGMSV30基于双链加接头方法,设计用于对经物理打断获得的DNA片段进行建库,并适配酶法转化工艺,将非甲基化的胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(U)。结合DNBSEQ平台,WGMSV30能够以单碱基精度解析DNA的甲基化状态,从而构建精细的全基因组甲基化图谱。

尊龙凯时MGIEasy V30高效全基因组甲基化文库制备助力甲基化研究

WGMSV30为多个领域提供了高效而准确的全基因组甲基化建库方案,这些领域包括大人群的表观组研究、表观遗传基础科学研究、动植物研究、疾病甲基化标志物筛选及药物研发等。目前,WGMSV30已适配MGISEQ-2000平台。借助MGISEQ-2000平台的升级算法,进行测序时无需添加平衡文库,从而实现了0平衡文库的纯甲基化文库测序。此外,尊龙凯时的研发团队已针对WGMSV30适配DNBSEQ-T7开展最后的稳定性测试,未来将持续分享更多的实测数据,敬请期待。

通过采用3个不同批次的WGMSV30构建NA12878标准品的DNA甲基化文库,未添加平衡文库,并平行在MGISEQ-2000ECR70(搭配SM测序试剂)和ECR71(搭配SM20测序试剂)上进行PE150测序,单lane reads的产出基本稳定在400M左右。每个文库可获得约120G的原始下机数据,轻松实现“1库1lane”,且测序质量良好。SM测序试剂的Q30稳定在89%左右,SM20测序试剂的Q30稳定在94%左右,Q40稳定在87%左右。这样的成就为医疗研究带来了显著的进展。

WGMSV30试剂盒适配的酶法转化过程损伤小,增大了文库插入片段长度,从而更好地支持PE150测序。不同批次的建库试剂盒构建的NA12878标准品DNA甲基化文库的插入片段(主峰约280bp)表现一致,确保了结果的可靠性。此外,试剂盒对末端修复反应体系和步骤进行了优化,降低了Reads末端M-bias碱基的个数。结合SM20版本序列的结果,各批次建库试剂盒构建的NA12878标准品DNA甲基化文库的M-bias表现一致,Bottom Strand和Top Strand的Read1和Read2甲基化率几乎重合,进一步提升了研究的可重复性和准确性。